Частное общеобразовательное учреждение «Православная Гимназия во имя Преподобного Сергия Радонежского» учреждено Местной православной религиозной организацией «Приход храма в честь Всех святых, в земле Русской просиявших Академгородка (Советского района) г. Новосибирска Новоибирской Епархии Русской Православной Церкви (Московский Патриархат)» по инициативе научной общественности Академгородка 19 августа 1992 г.